LigandBoxID:PDB_AR3

NAME:AR3;CYTARABINE;1-BETA-D-ARABINOFURANOSYLCYTOSINE; ARA-C
SMILES: OCC1OC(N2C=CC(=NC2=O)N)C(C1O)O

2D 3D

select 3D conformers:
SDF file MOL2 file

Compound ID of the source

PDBLigandExpo

Calculated physical properties

MOLECULAR_FORMULA MOLECULAR_WEIGHT MOLECULAR_CHARGE NUM_OF_DONOR
C9H13N3O5 243.219 0 5
NUM_OF_ACCEPTOR NUM_OF_CHIRAL_ATOMS LUMO HOMO
6 4 -0.3406 -9.6252
mLOGS mLOGD mLOGPA  
-0.801 0.030 -6.025  

Links to the same SMILES compounds

LIGANDBOX D00168 D03637 D07769 HTS2204-00102015 HTS2204-00110579
HTS2204-00138527 HTS2204-00138528 KSH2210-00023828 KSH2210-00600258 KSH2210-02569517 PDB_CTN
CHEMBL CHEMBL1256472 CHEMBL1315342 CHEMBL163754 CHEMBL1978548 CHEMBL2028065
CHEMBL2092816 CHEMBL2093067 CHEMBL2448171 CHEMBL3350527 CHEMBL4237960 CHEMBL605037
CHEMBL78 CHEMBL803 CHEMBL95606
PUBCHEM 100935585 101610685 101638449 10250841 102601364
102602088 11534437 117732781 11791524 118116881 118482994
118482996 118718984 118903262 118903264 121486971 121487027
121487034 121487038 12153975 121596077 122468509 123214154
12358850 12358851 123837539 124080914 1265901 129660760
129849649 130446749 131701110 131723190 131723191 133126473
134588422 134608047 135367302 136276541 136364023 136417158
136443348 136947788 137281684 137281685 137308271 137524713
137533712 138544775 139025281 139490031 139510000 139510001
140557801 141758469 142117909 145418822 145779877 146464453
148710634 154746980 154746981 155195661 155296463 156086629
156086655 156151778 156697930 156741732 160209502 161517216
161578041 162064659 162106383 16212026 162127488 162127489
164853206 167558206 16760387 168007247 18531093 20831676
21117014 21119263 21120204 21141018 21141019 21327967
21725490 21868284 23615259 23615268 23615334 23615336
23615337 23616184 23616201 23616220 23618640 23619026
24197391 24198559 24729357 25085165 3013211 3246589
44134646 44264135 44307610 44356841 44470396 45109772
45375834 4611947 46912694 46912695 49849608 49873512
49873513 49873519 49873529 50909509 50933301 50937384
51371137 54353063 5702244 57369276 57764456 57807005
58460874 58519508 58899188 59476533 59713247 60138999
638040 6394229 6476646 6479885 6480064 6551012
6603781 66589457 66589459 66589497 66658973 66659082
66686495 66729542 66729562 66739732 66787711 66799802
66799865 66800112 66918377 66940188 66966609 67001131
67030948 6713581 6713582 67276734 67327365 67503441
67615341 67679737 67724780 67742426 67747059 67802644
67831264 67843398 67983243 68199635 68313980 68470506
68502746 68628974 68656614 68663286 68803664 68805412
68986405 69055335 69248697 69371707 69621045 69636384
69636385 69639679 69639684 69718849 69723238 69723239
69724539 69744399 69826401 69911060 69912436 69912543
69932996 69964045 69975489 70006743 70018716 70133682
70138790 70296606 70362721 70386093 70386095 70421808
70426247 70426251 70624826 70994952 71076612 71230474
71315149 73672689 73672976 73743955 74764111 87060455
87079988 87118711 87141834 87166067 87166068 87298819
87647732 87812518 87816179 87826841 87930512 87930513
87997488 88049507 88049520 88080752 88122118 88190543
88292634 88292635 88292680 88292681 88447780 88633689
88688938 88790799 88810867 89252979 89253153 89486874
89495334 90089493 90302914 90472732 91142034 91278098
91868577 9911953

[Back to top page]