LigandBoxID:PDB_DLY

NAME:DLY;D-LYSINE
SMILES: NCCCCC(C(=O)O)N

2D 3D

select 3D conformers:
SDF file MOL2 file

Compound ID of the source

PDBLigandExpo

Calculated physical properties

MOLECULAR_FORMULA MOLECULAR_WEIGHT MOLECULAR_CHARGE NUM_OF_DONOR
C6H14N2O2 146.190 0 5
NUM_OF_ACCEPTOR NUM_OF_CHIRAL_ATOMS LUMO HOMO
2 1 -4.3878 -11.1027
mLOGS mLOGD mLOGPA  
1.792 -2.011 -4.801  

Links to the same SMILES compounds

LIGANDBOX D02278 D02279 D02304 D06469 HTS2204-00099124
HTS2204-00099125 HTS2204-00099126 HTS2204-00100164 HTS2204-00100165 KSH2210-00017453 KSH2210-00019731
KSH2210-02575020 KSH2210-02575674 KSH2210-02575720 KSH2210-02575742 KSH2210-02576464 PDB_LYS
PDB_LYS_LEO2 PDB_LYS_LEO2H PDB_LYS_LEO2H_DHZ3 PDB_LYS_LEO2_DHZ3 PDB_LYS_LFOH PDB_LYS_LFOH_DHZ3
PDB_LYS_LFZW PDB_LYS_LFZW_DHZ3
CHEMBL CHEMBL2104640 CHEMBL2105886 CHEMBL28328 CHEMBL319497 CHEMBL8085
PUBCHEM 10013302 10044400 101504129 10154196 101611383
10171465 101738686 101738688 10176705 101966858 10201679
102332611 102351657 102351658 10290870 10308417 10313213
10326246 10360744 10377113 10380632 10421530 10466901
110190615 110191466 110191842 11640127 11689470 11704202
11722496 11738404 117666093 117666095 117679316 117777055
117777056 117890040 117890041 117940273 117940274 117964332
117967322 118063750 118143399 118211561 118211594 118211778
118211779 118264373 118274054 118274056 118275559 118275560
11846059 118484001 118484256 118514780 118524989 118525388
118561786 118561787 118600118 118918897 118976117 11990044
11993797 12112524 121289537 121302492 12135279 121407790
121439677 12149172 12149174 12149175 12205346 12205349
12205352 12205353 12205354 12205357 12205358 12205360
12205361 12205362 12205363 12205365 12205370 12205371
122198194 122482874 122482875 122506463 122589645 122684580
122705181 124107958 124107959 124157119 124202796 126481833
126481834 126483691 126483692 126566323 126566324 126600951
126738665 129240111 129246581 129642801 129654291 129717916
129727895 129729441 129730608 129846961 129846963 129865884
130205581 130205583 130332070 130346519 131637620 131667874
131708616 131708617 131708620 131708624 131708625 131708708
131708709 131713241 131723438 131726306 131734558 131734559
131736704 131737744 131742000 131842503 131852319 131852320
131854681 131854682 131856097 132059975 132115385 132115386
132191069 132256971 132256972 132257255 13230917 13232125
13245170 133109130 133126736 134261062 134262547 134262548
134498340 134519900 134587800 135155117 135155118 135155119
135207569 135247030 135307531 135314408 135354213 135387551
135739674 135739675 13589042 136349876 136349877 137182689
137408659 137440563 137440872 137464631 138505331 138592337
138741112 139054106 139059340 139063420 139063602 139063757
139064893 139071806 139142913 139148726 139593441 139626722
139629253 139708108 139729407 139765721 139776614 139789862
139847580 139899650 139906173 140007611 140162496 140205166
140236088 140236095 140236099 140236131 140236144 140236153
140236173 140236185 140236203 140236215 140236234 140236242
140236245 140236262 140236268 140236277 140236281 140236282
140236306 140236331 140236347 140236354 140236381 140236382
140256788 140329097 140380953 140380956 140533859 140586068
140658036 140673065 140679869 140866166 140866169 140886225
140936693 141064816 141083994 141123525 141160501 141241661
141416004 141515524 141578762 141740771 141762631 141774376
142301371 142301372 142314841 142601420 142665494 142684658
142685048 14308353 143485170 14406340 14406341 14459758
144804791 145101072 145183110 145373262 145603239 145710054
145710293 145856618 145856619 146310735 146401285 146440857
146440859 146455330 14772515 14772561 148178435 150791321
152748228 153371046 153408477 153408479 153521975 153528380
153611610 153611611 153611612 153611613 153611614 153693994
153694824 153694890 153711326 154490153 154641485 154983277
155058092 155164036 155195176 155195729 155351657 155618324
155640846 155679852 155776846 156025253 156152494 156209671
156562954 156562956 156632780 156690599 156777912 156779711
156785496 15692401 157049505 157101900 157113191 157115022
157116773 157131206 157140470 157161096 157183595 157196743
157212643 157221699 157506906 157510194 157519605 157539925
157570750 157576570 157578900 157588988 157622658 157632582
157655138 157662871 157694539 157709905 158017073 158095718
158102627 158104790 158118637 158118639 158151443 158162060
158173801 158181468 158191881 158199726 158203366 158208197
158211470 158216725 158520002 158534051 158540866 158540867
158542841 158570054 158572828 158576614 158609799 158620708
158620747 158620748 158620749 158622189 158682170 158688424
159012350 159026081 159040267 159046503 159068423 159071119
159106141 159106142 159106143 159106144 159166235 159169703
159169704 159176078 159191640 159543275 159546813 159570835
159573614 159617298 159628120 159652621 159652622 159653004
159653072 159698323 159703741 159709092 160003602 160007888
160019143 160025226 160027465 160033222 160099991 160182013
160205279 160506400 160524728 160525316 160528237 160533006
160561274 160571052 16057978 160609129 160610367 160627052
160641621 160658765 160662638 160690263 161000442 161000683
161063816 161065562 161098672 161109955 161110183 161170544
161189612 161190595 161521001 161521368 161522293 161523290
161545057 161563499 161563500 161569942 161574275 161581875
161600960 161615360 161623301 161627696 161630381 161635892
161640679 161694436 162033415 162117558 162117559 16211825
162125125 16213292 16213293 16213330 16213331 16213332
16213425 16213426 16213427 16213428 16213429 16213562
162144872 162171559 16217566 16217575 16217576 16217577
16217578 162182541 16219563 16219815 162642137 162642138
162642139 162642140 162716511 162716520 162768552 163406010
163408956 163408957 163408958 163409205 163409206 163479008
163550691 163610626 163625410 163637450 163642935 163701004
163706307 163882475 163952929 164005472 164017656 164025201
164080511 164104124 164133775 164154588 164167981 164180032
164511648 164520066 164852697 165023999 165362704 165362927
165412530 165413541 166694456 166709957 166710031 166729639
166748944 166793552 16739498 167473823 167473831 167567716
167615616 167687040 168007633 18176078 18320454 18320994
18327168 18338427 18386514 18394839 18395315 18396174
18397618 18405887 18411552 18444119 18462789 18519421
18595216 18615877 18626441 18635636 18639104 18639105
18644880 18645721 18645722 18647011 18649695 18650035
18653919 18658435 18662922 18667271 18667272 18671225
18681271 18705543 18718238 18757311 18757316 18763797
18793360 18916164 18927052 18974591 18974592 18988772
19021117 19021120 19044009 19351981 19366502 19389460
19431333 19432331 19811129 19837368 19865348 19881015
19961328 19961329 19962684 19991029 19991030 19991033
19991034 20033453 20146116 20316938 20319533 20319541
20477698 20598904 20638056 20638459 20644271 20674627
20693462 20715479 20717350 20725497 20751279 21114130
21133830 21133831 21151737 21189288 21189364 21195547
21201102 21201104 21201105 21201107 21252811 21294829
21325638 21340300 21392015 21392022 21392025 21392038
21392043 21477366 21537244 21555299 21832753 21846779
21872298 21881610 21901076 21909941 21960608 21972528
21987572 22569058 22610746 22624846 22644495 22648775
22675588 22675591 22709001 22722160 22728661 22794536
22799961 22800572 22800644 22809366 22820953 22820954
22823930 22825130 22826676 22828848 22839527 22844369
22857104 22860831 22860832 22864009 22870971 22872766
22876984 22883521 22897656 22903049 22922800 22947934
22967421 22988912 23028470 23037163 23042340 23361009
23391569 23450210 23504477 23513374 23513545 23534249
23558608 23676115 23676116 23681718 23700870 23708983
24187205 24848423 25016585 25022320 25052293 25097474
2734605 3000287 3041053 3080814 3080858 3460111
3532358 3654176 3784624 44120031 44148648 44148756
44148760 44231977 4477687 44828557 44828780 45157533
45157534 45382156 46207333 49856215 49856216 49873790
50910057 50910849 50992680 51358362 517015 517175
53259010 53394783 53395018 53395194 53989584 53989588
53989590 53989591 54766114 56843351 57397080 57428913
57445013 57450579 57451730 57454510 57464864 57616908
57616911 57616912 57616921 58203005 58219022 58219025
58359512 58618378 59069846 59373180 59373182 59703106
59857902 60162674 60164465 60172945 60172948 60172949
60198666 6338418 6338419 641599 6454211 66650556
66650557 66650567 66650569 66650633 66650635 66664606
66894610 66894611 66973332 67068624 67283875 67332669
67334864 67364980 67364982 67421515 67428272 67479156
67493996 67512498 67512501 67611924 67778185 67920443
67934661 67934663 68275955 68275956 68276010 68276011
68283155 68447040 68511629 68517853 68524446 68577116
68577118 68820431 68833748 68833753 69049434 69113996
69256021 69297238 69459676 69603065 69603066 69906804
69906806 69965206 70042413 70139037 70185036 70185159
70255478 70503213 70503215 70524781 70530779 70530782
70594272 70628909 71309083 71309084 71309085 71309188
71309189 71309234 71309632 71309642 71309643 71310242
71310243 71310290 71428883 71472689 71476835 71585096
71585097 71585118 71587189 71657417 71749819 71771785
71774817 72544044 72715408 72941658 73050802 73062904
73124227 73947352 74764828 75124169 76281759 76281760
76286989 76540154 76545518 76548180 76958836 77460719
77508537 77790397 78121982 78178522 78302003 85059421
85891483 86604974 86615832 86622661 86632287 86698941
86735116 86749085 86750663 86750665 86750666 86752372
86753935 86753936 86758390 86759313 86759314 86760463
86760467 87059291 87061463 87074125 87089361 87090324
87094763 87099989 87105558 87109172 87110947 87115500
87115501 87126823 87131354 87131370 87138848 87139717
87141445 87151093 87173027 87178752 87186096 87190895
87191156 87191245 87191323 87196694 87196732 87202849
87213459 87233187 87233188 87236969 87243015 87244372
87244373 87244390 87248421 87251184 87253984 87253985
87256813 87257157 87257158 87257211 87257212 87266715
87271833 87274982 87275719 87292544 87296757 87296758
87307778 87311886 87316835 87316836 87319825 87326612
87327334 87327335 87328178 87328180 87328722 87329823
87334073 87346757 87350497 87357768 87358607 87358846
87370577 87370787 87371477 87371487 87371489 87371781
87372700 87374987 87374988 87382720 87383241 87383242
87388566 87395550 87400457 87416102 87457016 87467433
87467434 87468219 87468360 87473468 87478388 87493163
87494707 87500721 87503312 87503314 87514828 87514979
87524773 87524775 87526309 87526310 87528070 87528357
87528369 87535237 87535623 87537025 87537026 87537027
87546396 87568951 87578390 87578391 87578896 87580628
87580629 87581858 87581859 87585836 87586096 87591417
87602877 87642935 87643042 87656100 87664370 87667600
87667601 87692512 87692513 87698324 87698326 87701889
87706019 87708829 87708831 87710942 87710951 87710952
87724113 87724114 87744212 87755164 87756092 87764257
87767351 87767545 87771623 87771624 87791000 87791001
87800370 87800371 87809111 87814023 87824748 87835222
87836291 87842974 87845275 87845276 87852895 87858364
87877472 87879321 87895228 87930746 87930747 87930748
87941858 87941859 87946528 87957737 87968909 87993726
88000523 88007872 88011293 88012542 88013365 88013367
88013770 88013771 88022703 88031551 88032103 88042071
88066072 88075957 88075958 88078041 88078545 88079748
88079749 88079751 88080763 88093586 88119887 88120361
88146106 88146492 88163635 88166788 88172967 88201260
88203141 88203150 88203154 88203960 88203963 88203970
88203987 88203991 88204026 88204038 88204062 88204063
88204271 88204272 88204284 88204287 88204290 88204291
88204322 88204325 88204327 88204356 88204403 88204404
88204492 88204500 88204535 88204580 88219820 88230590
88230596 88234127 88234128 88235188 88235189 88238768
88238769 88238811 88238812 88238814 88240327 88240328
88240357 88240358 88240360 88240362 88240480 88240481
88240485 88240487 88240524 88240545 88240546 88240700
88240703 88240705 88240707 88240770 88240771 88240827
88240828 88240835 88240836 88241032 88241033 88241036
88241038 88241049 88241050 88241056 88241101 88241104
88241105 88241117 88241129 88241130 88241137 88241139
88241152 88266171 88289751 88291551 88291552 88296635
88312554 88312556 88312642 88312756 88312757 88312851
88312854 88312936 88312938 88312959 88312960 88314581
88322384 88326295 88326520 88334445 88338293 88345607
88345608 88361000 88361001 88361005 88372659 88372690
88379319 88385604 88390401 88390405 88395199 88395200
88397951 88400346 88415524 88416979 88416980 88416984
88427275 88432652 88443208 88443209 88443210 88457770
88464758 88470435 88470603 88477934 88478890 88478895
88478898 88483769 88510580 88510582 88512640 88512642
88512654 88512660 88512661 88512665 88512666 88512669
88512672 88526098 88546532 88600070 88619211 88655180
88683739 88683741 88683742 88686626 88712737 88736910
88744012 88791387 88793851 88793854 88799943 88801352
88815315 88815335 88815350 88815449 88835472 88835534
88835979 88835984 88836346 88836348 88876386 88876387
88876401 88901890 88901892 88901900 88901911 88919379
88919407 88919408 88919953 88920134 88952248 88996331
88996332 89059446 89188622 89315545 89350786 89392490
89422040 89422041 89422043 89422044 89422125 89422126
89477225 89512034 89512036 89512037 89557087 89557088
89585562 89646935 89690628 89690629 89713848 89826341
90002013 90002014 90021346 90021348 90022254 90119878
90119881 90122748 90124080 90186962 90369132 90389224
90470928 90472334 90862357 91866782 91869589 91872985
92043531 9822822 9834327 9838476 9866963 9881172
9883132 9896361 9903355 9903698 9920708 9920709
9926090 9950558 9965146 9970608 9992294

[Back to top page]