LigandBoxID:PDB_ORN

NAME:ORN;L-ornithine
SMILES: NCCCC(C(=O)O)N

2D 3D

select 3D conformers:
SDF file MOL2 file

Compound ID of the source

PDBLigandExpo

Calculated physical properties

MOLECULAR_FORMULA MOLECULAR_WEIGHT MOLECULAR_CHARGE NUM_OF_DONOR
C5H12N2O2 132.163 0 5
NUM_OF_ACCEPTOR NUM_OF_CHIRAL_ATOMS LUMO HOMO
2 1 -4.8122 -11.1529
mLOGS mLOGD mLOGPA  
1.884 -2.229 -4.706  

Links to the same SMILES compounds

LIGANDBOX D08302 D08303 HTS2204-00089861 HTS2204-00098919 HTS2204-00104067
HTS2204-00104068 KSH2210-02015291 KSH2210-02570651 KSH2210-02811236 PDB_ORD
CHEMBL CHEMBL103686 CHEMBL1972294 CHEMBL2009502 CHEMBL3184113 CHEMBL446143
PUBCHEM 101858409 10198813 10220941 102602015 102602056
11738885 117590582 118225043 118855844 124155611 12803273
129672987 129774635 129862128 130345419 131713240 131850163
132276579 132452140 134895646 137262656 137262657 138675055
139063616 139065250 139066626 139067130 139654166 139792973
140236135 140236143 140236300 140591646 140612245 141146382
141265442 141266461 141437978 141510142 141558648 141571794
141881813 141922305 141922328 142048353 142127510 14406339
14406343 144066465 145317687 14560767 145759271 145799703
153694935 153700895 153805329 154574936 154635154 154804371
154804372 154984345 154984346 154984348 15556558 155634913
157139920 157234022 157521904 157533700 157547233 158022308
158037116 158215839 159662983 160057295 160201745 160211158
160511316 161123743 161134693 162106416 162124885 162155228
162163565 162190606 16219818 162642355 162642356 162642357
162642358 163580064 163804966 164873351 164873354 164873355
164873358 16755645 16755646 18330771 18425961 18689615
18728984 18764674 19419147 19688960 19692004 19736246
19981304 20849226 21299891 21392020 21392021 21392036
21392037 21392040 21481956 21564390 21734049 21969276
22616875 22722158 22800573 22852479 22872769 22996995
23174108 23356028 23358634 23358635 24196290 24802442
25022030 25167300 25232820 25232821 3274882 3350920
3530558 43833493 44148292 44151051 44151178 44181871
46932126 46932127 51064116 53486236 53643159 56838280
56839314 56839315 56839316 56839317 56846394 56959574
58203009 59373184 59373189 59565831 60169378 6451930
6452007 6453938 66575787 66709691 66799744 66799745
67618391 6992088 6992105 70552135 71309855 71309856
71309858 71309859 71684671 71751344 71751345 71774647
73994956 74319436 74765349 76045295 76971143 78168822
86271699 86628855 86628856 86628857 86735289 86744804
86745105 87060624 87062007 87062008 87096310 87105345
87105346 87134096 87148511 87148512 87186174 87187240
87237820 87257518 87278864 87299143 87299144 87326081
87349713 87399100 87399532 87399907 87400094 87400095
87464210 87464211 87528483 87573414 87575490 87575534
87586026 87586027 87600056 87601015 87732024 87842923
87859232 87967061 87967062 87982628 88006815 88010589
88237551 88237553 88264239 88264240 88294975 88310661
88312754 88312759 88312819 88313079 88313082 88313333
88385937 88385958 88401146 88401148 88401149 88407040
88414248 88414250 88414251 88426101 88434760 88437530
88457455 88480830 88532591 88605879 88605880 88605881
88630518 88747248 88815336 88815374 88815427 88819989
88836930 89350740 89350741 89690346 89690350 89854435
89854589 90119493 90119497 90303944 90303946 90389383
90389384 90459084 90470999 91177894 9547942 9816082
9838116 9899712 9903354

[Back to top page]